Jätevesi virtaa neutralointikaivon läpi vapaasti. pH-arvon ylittäessä tai alittaessa raja-arvon käynnistyy neutralointiliuoksen annostelupumppu sekä sekoitin. Neutraloinnin tapahduttua annostelupumppu ja sekoitin pysähtyvät. Neutra-neutralointikaivo voidaan tarvittaessa toimittaa kahdella annostelupumpulla jolloin voidaan neutraloida sekä hapanta että emäksistä jätevettä. Neutraan ei saa johtaa saniteettivesiä tai muita vastaavia jätevesiä. Mahdolliset kiintoaineet on erotettava ennen neutralointijärjestelmää.